2000年（平成12年）から2009年（平成21年）までのベストセラー本をリストアップしています。
調査データは、2006年までは 全国出版協会 、2007年以降は トーハンから。
年毎のベストセラー本は、「歴代のベストセラー本」ページをご参照ください。
- だから、あなたも生きぬいて：大平光代：講談社
- 話を聞かない男、地図が読めない女：アラン・ピーズ：主婦の友社
- ハリー・ポッターと賢者の石 ハリー・ポッターと秘密の部屋：Ｊ．Ｋ．ローリング：静山社
- これを英語で言えますか？：講談社インターナショナル編：講談社インターナショナル
- 「捨てる！」技術：辰巳 渚：宝島社
- 新・人間革命（７・８）：池田大作：聖教新聞社
- 太陽の法：大川隆法：幸福の科学出版
- 子どもが育つ魔法の言葉：Ｄ．Ｌ．ノルトほか：ＰＨＰ研究所
- 経済のニュースが面白いほどわかる本 日本経済編：細野真宏：中経出版
- 人生の目的：五木寛之：幻冬舎
- いきなり！黄金伝説。超節約レシピ５０：テレビ朝日編：テレビ朝日事業局出版部
- 五体不満足：乙武洋匡：講談社
- アタマにくる一言へのとっさの対応術：バルバラ・ベルクハン：草思社
- 命：柳 美里：小学館
- 巨泉 人生の選択：大橋巨泉：講談社
- プラトニック・セックス：飯島 愛：小学館
- 永遠の仔（上・下）：天童荒太：幻冬舎
- 朗読者：Ｂ．シュリンク：新潮社
- 続・伊藤家の食卓 裏ワザ大全集 ２０００年版：日本テレビ編：日本テレビ放送網
- 母の舞：池田大作：聖教新聞社
- 永遠の仏陀：大川隆法：幸福の科学出版
- ＬＯＶＥ論：つんく：新潮社
- 生きています、１５歳：井上美由紀：ポプラ社
- できるWord2000 Windows版：田中 亘＆インプレス書籍編集部編：インプレス
- できるExcel2000 Windows版：小舘由典＆インプレス書籍編集部編：インプレス
- 経済ってそういうことだったのか会議：佐藤雅彦・竹中平蔵：日本経済新聞社
- なりたい自分になる１００の方法：中山庸子：幻冬舎
- 君ならできる：小出義雄：幻冬舎
- 上司が「鬼」とならねば、部下は動かず：染谷和巳：プレジデント社
- 株で１億円作る！：仁科剛平：ダイヤモンド社
- チーズはどこへ消えた？：スペンサー・ジョンソン：扶桑社
- ハリーポッターと賢者の石 ハリーポッターと秘密の部屋 ハリーポッターとアズカバンの囚人：Ｊ．Ｋ．ローリング：静山社
- 奇跡の法：大川隆法：幸福の科学出版
- 金持ち父さん貧乏父さん：ロバート・キヨサキ シャロン・レクター：筑摩書房
- 新・人間革命（９・１０）：池田大作：聖教新聞社
- 話を聞かない男、地図が読めない女：アラン・ピーズほか：主婦の友社
- 十二番目の天使：オグ・マンディーノ：求龍堂
- プラトニック・セックス：飯島 愛：小学館
- 仕事ができる人 できない人：堀場雅夫：三笠書房
- バトル・ロワイアル：高見広春：太田出版
- 光に向かって１００の花束：高森顕徹：１万年堂出版
- 市販本 新しい歴史教科書：西尾幹二ほか：扶桑社
- 声に出して読みたい日本語：齋藤 孝：草思社
- The Blue Day Book：B．T．グリーヴ：竹書房
- 模倣犯（上・下）：宮部みゆき：小学館
- なぜか、「仕事がうまくいく人」の習慣：ケリー・グリーソン：ＰＨＰ研究所
- プロジェクトＸ リーダーたちの言葉：今井 彰：文藝春秋
- 「みにくいあひるの子」だった私：梅宮アンナ：講談社
- 竹中教授のみんなの経済学：竹中平蔵：幻冬舎
- なぜ生きる：明橋大二ほか 高森顕徹・監修：１万年堂出版
- ザ・ゴール：Ｅ．ゴールドラット：ダイヤモンド社
- 経済のニュースがよくわかる本：細野真宏：小学館
- 灰夜 新宿鮫（７）：大沢在昌：光文社
- 中坊公平・私の事件簿：中坊公平：集英社
- 精霊流し：さだまさし：幻冬舎
- ビストロスマップ 新世紀こだわりレシピ（１～４）：ビストロスマップ制作委員会編：フジテレビ出版
- バターはどこへ溶けた？：Ｄ．リップルウッド：道出版
- 新ゴーマニズム宣言ＳＰＥＣＩＡＬ 戦争論（２）：小林よしのり：幻冬舎
- アー・ユー・ハッピー？：矢沢永吉：日経ＢＰ
- 金田一少年の事件簿（９）邪宗館殺人事件：天樹征丸：講談社
- ハリーポッターと賢者の石、ハリーポッターと秘密の部屋、ハリーポッターとアズカバンの囚人、ハリーポッターと炎のゴブレット（上・下） ：Ｊ．Ｋ．ローリング：静山社
- ビック・ファット・キャットの世界一簡単な英語の本：向山淳子ほか：幻冬舎
- 生きかた上手：日野原重明：ユーリーグ
- 声に出して読みたい日本語：齋藤 孝：草思社
- 世界がもし１００人の村だったら：池田香代子ほか：マガジンハウス
- ベラベラブックｖｏｌ．１（青版）：国川恭子：ぴあ
- 新・人間革命（１１）：池田大作：聖教新聞社
- 常勝の法：大川隆法：幸福の科学出版
- 老いてこそ人生：石原慎太郎：幻冬舎
- 常識として知っておきたい日本語：柴田 武：幻冬舎
- 盲導犬クイールの一生：石黒謙吾：文藝春秋
- 青空のむこう：Ａ．シアラー：求龍堂
- 運命の足音：五木寛之：幻冬舎
- 図解「儲け」のカラクリ：インタービジョン２１編：三笠書房
- 模倣犯（上・下）：宮部みゆき：小学館
- 本当の学力をつける本：陰山英男：文藝春秋
- 男の子って、どうしてこうなの？：Ｓ．ビダルフ：草思社
- 人生百年 私の工夫：日野原重明：幻冬舎
- 海辺のカフカ（上・下）：村上春樹：新潮社
- ベッカム すべては美しく勝つために：Ｄ．ベッカム：ＰＨＰ研究所
- サタ★スマ：松前友博ほか編：角川書店
- 日本村１００人の仲間たち：吉田 浩：日本文芸社
- ライオンは眠れない：Ｓ．ライダー：実業之日本社
- 松本裁判：松本人志：ロッキング・オン
- 親日派のための弁明：金 完燮：草思社
- ザ・ゴール２：Ｅ．ゴールドラット：ダイヤモンド社
- 声に出して読みたい日本語２：齋藤 孝：草思社
- 英語で日記を書いてみる：石原真弓：ベレ出版
- Snap SMAPドキュメンタリーフォトブック：宮本敬文・撮影：ビクターエンタテイメント
- サディスファクション：Ｋ．キャトラルほか：アーティストハウス
- バカの壁：養老孟司：新潮社
- 世界の中心で、愛をさけぶ：片山恭一：小学館
- トリビアの泉 へぇの本（１～４）：フジテレビトリビア普及委員会編：講談社
- ベラベラブック-２：ＳｍａＳＴＡＴＩＯＮ-２：マガジンハウス
- 開放区：木村拓哉：集英社
- 新・女性抄：池田大作：潮出版社
- 大悟の法：大川隆法：幸福の科学出版
- マンガ金正日入門：李 友情／李 英和：飛鳥新社
- ダイエットＳＨＩＮＧＯ：香取慎吾：マガジンハウス
- 嘘つき男と泣き虫女：アラン・ピーズほか：主婦の友社
- 祇園の教訓：岩崎峰子：幻冬舎
- ベラベラブックＶｏｌ．1（青版）：国川恭子：ぴあ
- 学力は家庭で伸びる：陰山英男：小学館
- 「体を温める」と病気は必ず治る：石原結實：三笠書房
- ユダヤ人大富豪の教え：本田 健：大和書房
- 有効期限の過ぎた亭主・賞味期限の切れた女房：綾小路きみまろ：ＰＨＰ研究所
- 新ゴーマニズム宣言ＳＰＥＣＩＡＬ戦争論（３）：小林よしのり：幻冬舎
- 半落ち：横山秀夫：講談社
- 朝には紅顔ありて：大谷光真：角川書店
- 「原因」と「結果」の法則：ジェームズ・アレン：サンマーク出版
- 頭がいい人の習慣術：小泉十三：河出書房新社
- Deep Love アユの物語 完全版：Deep Love 第二部 ホストDeep Love 第三部 レイナの運命Deep Love 特別版 パオの物語 Ｙｏｓｈｉ：スターツ出版
- すべては「単純に（シンプロファイ）！」でうまくいく：Ｌ．Ｊ．ザイヴァートほか：飛鳥新社
- 陰摩羅鬼の瑕：京極夏彦：講談社
- バトル・ロワイアルⅡ 鎮魂歌（レクイエム）：松江松恋：太田出版
- 社長をだせ！実録クレームとの死闘：川田茂雄：宝島社
- お金持ちになれる黄金の羽根の拾い方：橘 玲：幻冬舎
- キャッチャー・イン・ザ・ライ：Ｊ．Ｄ．サリンジャー：白水社
- １３カ月と１３週と１３日と満月の夜：アレックス・シアラー：求龍堂
- ブレイブ・ストーリー（上・下）：宮部みゆき：角川書店
- ハリーポッターと不死鳥の騎士団（上・下）：Ｊ．Ｋ．ローリング：静山社
- 世界の中心で、愛をさけぶ：片山恭一：小学館
- バカの壁：養老孟司：新潮社
- グッドラック：Ａ．ロビラ フェルナンド・トリアス・デ・ベス：ポプラ社
- 蹴りたい背中：綿矢りさ：河出書房新社
- １３歳のハローワーク：村上 龍 はまのゆか・絵：幻冬舎
- 川島隆太教授の脳を鍛える大人の音読ドリル 川島隆太教授の脳を鍛える大人の計算ドリル：川島隆太：くもん出版
- キッパリ！たった５分間で自分を変える方法：上大岡トメ：幻冬舎
- いま、会いにゆきます：市川拓司：小学館
- 新・人間革命（１２・１３）：池田大作：聖教新聞社
- 死の壁：養老孟司：新潮社
- もうひとつの冬のソナタ：キム・ウニ ユン・ウンギョン：ワニブックス
- 幸福の法：大川隆法：幸福の科学出版
- 蛇にピアス：金原ひとみ：集英社
- 頭がいい人、悪い人の話し方：樋口裕一：ＰＨＰ研究所
- 冬のソナタ（上・下）：キム・ウニ ユン・ウンギョン：日本放送出版協会
- 自分のまわりにいいことがいっぱい起こる本：原田真裕美：青春出版社
- 電車男：中野独人：新潮社
- ダ・ヴィンチ・コード（上・下）：ダン・ブラウン：角川書店
- たったひとつのたからもの：加藤浩美：文藝春秋
- アフターダーク：村上春樹：講談社
- Deep Love アユの物語 完全版：Deep Love 第二部 ホストDeep Love 第三部 レイナの運命Deep Love 特別版 パオの物語 ：Ｙｏｓｈｉ：スターツ出版
- 最驚！ガッツ伝説：ガッツ石松、鈴木佑季・監修 ＥＸＣＩＴＩＮＧ編集部編：光文社
- 博士の愛した数式：小川洋子：新潮社
- 空中ブランコ：奥田英朗：文藝春秋
- 負け犬の遠吠え：酒井順子：講談社
- インストール：綿矢りさ：河出書房新社
- 上司は思いつきでものを言う：橋本 治：白水社
- 誰か：宮部みゆき：実業之日本社
- 号泣する準備はできていた：江國香織：新潮社
- 頭がいい人、悪い人の話し方：樋口裕一：ＰＨＰ研究所
- 香峯子抄：池田香峯子・述 主婦の友社編著：主婦の友社
- さおだけ屋はなぜ潰れないのか？：山田真哉：光文社
- 新・人間革命（１４）：池田大作：聖教新聞社
- これだは知っておきたい個人情報保護：岡村久道 鈴木正朝 ：日本経済新聞社
- 「もっと、生きたい・・・」：Ｙｏｓｈｉ：スターツ出版
- 電車男：中野独人：新潮社
- 神秘の法：大川隆法：幸福の科学出版
- 問題な日本語：北原保雄編：大修館書店
- ワルの知恵本：門 昌央 人生の達人研究会：河出書房新社
- 東京タワー：リリー・フランキー：扶桑社
- 恋バナ（青・赤）：Ｙｏｓｈｉ：スターツ出版
- 野ブタ。をプロデュース：白岩玄：河出書房新社
- ハッピーバースデー：青木和雄 吉富多美：金の星社
- ダ・ヴィンチ・コード（上・下）：ダン・ブラウン：角川書店
- 生きて死ぬ智慧：柳澤桂子 堀 文子・画 白石昌則 東京農工大学の学生の皆さん：小学館
- 生協の白石さん：白石昌則 東京農工大学の学生の皆さん：講談社
- 下流社会：三浦 展：光文社
- 病気にならない生き方：新谷弘実：サンマーク出版
- 骨盤教室：寺門琢己：幻冬舎
- いま、会いにゆきます：市川拓司：小学館
- グッドラック：アレックス・ロビラ フェルナンド・トリアス・デ・ベス：ポプラ社
- キッパリ！たった５分間で自分を変える方法：上大岡トメ：幻冬舎
- 細野真宏の世界一わかりやすい株の本：細野真宏：文藝春秋
- バカの壁：養老孟司：新潮社
- 自分のまわりにいいことがいっぱい起こる本：原田真裕美：青春出版社
- 靖国問題：高橋哲哉：筑摩書房
- D.Gray-man reverse１：城崎火也 星野 桂・イラスト ：集英社
- 半島を出よ（上・下）：村上 龍：幻冬舎
- 人はなぜ生まれいかに生きるか：江原啓之：ハート出版
- 国家の品格：藤原正彦：新潮社
- ハリー・ポッターと謎のプリンス（上・下）：Ｊ．Ｋ．ローリング：静山社
- 東京タワー：リリー・フランキー：扶桑社
- えんぴつで奥の細道：大迫閑歩書 伊藤 洋監修：ポプラ社
- 病気にならない生き方：新谷弘実：サンマーク出版
- 人は見た目が９割：竹内一郎：新潮社
- 新・人間革命（１５～１６）：池田大作：聖教新聞社
- 子育てハッピーアドバイス（１～３）：明橋大二：１万年堂出版
- 鏡の法則：野口嘉則：総合法令出版
- 陰日向に咲く：劇団ひとり：幻冬舎
- 恋空（上・下）：美嘉：スターツ出版
- 生協の白石さん：白石昌則 東京農工大学の学生の皆さん：講談社
- 超バカの壁：養老孟司：新潮社
- 美しい国へ：安倍晋三：文藝春秋
- 容疑者Ｘの献身：東野圭吾：文藝春秋
- 食品の裏側：安部 司：東洋経済新聞社
- 下流社会：三浦 展：光文社
- オシムの言葉：木村元彦：集英社インターナショナル発行 集英社発売
- 世界の日本人ジョーク集：早坂 隆：中央公論新社
- 人はなぜ生まれいかに生きるか：江原啓之：ハート出版
- ９９・９％は仮説：竹内 薫：光文社
- ウェブ進化論：梅田望夫：筑摩書房
- 他人を見下す若者たち：速水敏彦：講談社
- なぜ、社長のベンツは４ドアなのか？：小堺桂悦郎：フォレスト出版
- さおだけ屋はなぜ潰れないのか？：山田真哉：光文社
- 希望の花束：創価学会婦人部：聖教新聞社
- 希望の法：大川隆法：幸福の科学出版
- 天使がくれたもの：Ｃｈａｃｏ：スターツ出版
- 苦難の乗り越え方：江原啓之：ＰＡＲＣＯ出版
- 頭がいい人、悪い人の話し方：樋口裕一：ＰＨＰ研究所
- 女性の品格 装いから生き方まで：坂東眞理子：ＰＨＰ研究所
- ホームレス中学生：田村 裕：ワニブックス
- 鈍感力：渡辺淳一：集英社
- 日本人のしきたり：飯倉晴武 編著：青春出版社
- 新・人間革命（17）：池田大作：聖教新聞社
- 田中宥久子の造顔マッサージ：田中宥久子：講談社
- ハローバイバイ・関暁夫の都市伝説 信じるか信じないかはあなた次第
：関 暁夫：竹書房 - ポケットモンスター ダイヤモンド・パール 公式全国大図鑑：ファミ通書籍編集部：エンターブレイン
- ポケットモンスター ダイヤモンド・パール 公式ぜんこく図鑑完成ガイド ：元宮秀介＆ﾜﾝﾅｯﾌﾟ編著：メディアファクトリー
- 恋空 切ナイ恋物語 (上) 恋空 切ナイ恋物語 (下) ：美嘉：スターツ出版
- 国家の品格：藤原正彦：新潮社
- 赤い糸 (上) 赤い糸 (下) ：メイ：ゴマブックス
- 君空 ‘koizora’another story：美嘉：スターツ出版
- 一瞬の風になれ (1)一瞬の風になれ (2)一瞬の風になれ (3) ：佐藤多佳子：講談社
- もしもキミが。：凛：ゴマブックス
- ポケットモンスターダイヤモンド ポケットモンスターパール パーフェクトクリアＢｏｏｋ ：ＮｉｎｔｅｎｄｏＤＲＥＡＭ編集部：毎日コミュニケーションズ社
- いつまでもデブと思うなよ：岡田斗司夫：新潮社
- 生物と無生物のあいだ：福岡伸一：講談社
- 世界の日本人ジョーク集：早坂 隆：中央公論新社
- ｢１日３０分｣を続けなさい！人生勝利の勉強法55 ：古市幸雄：マガジンハウス
- ハリー・ポッターと死の秘宝：Ｊ・Ｋローリング 松岡佑子 訳：静山社
- 夢をかなえるゾウ：水野敬也：飛鳥新社
- Ｂ型自分の説明書：Ｊａｍａｉｓ：文芸社
- Ｏ型自分の説明書：Ｊａｍａｉｓ：文芸社
- Ａ型自分の説明書：Ｊａｍａｉｓ：文芸社
- ホームレス中学生：田村 裕：ワニブックス
- 女性の品格 装いから生き方まで：坂東眞理子：ＰＨＰ研究所
- 親の品格：坂東眞理子：ＰＨＰ研究所
- ＡＢ型自分の説明書：Ｊａｍａｉｓ：文芸社
- 脳を活かす勉強法 奇跡の「強化学習」：茂木健一郎：ＰＨＰ研究所
- 新・人間革命（18）新・人間革命（19） ：池田大作：聖教新聞社
- 流星の絆：東野圭吾：講談社
- 悩む力：姜尚中：集英社
- おつまみ横丁 すぐにおいしい酒の肴185：編集工房桃庵編：池田書店
- おひとりさまの老後：上野千鶴子：法研
- 余命１ヶ月の花嫁：ＴＢＳ「イブニング・ファイブ」編：マガジンハウス
- 徳間アニメ絵本 崖の上のポニョ：宮崎 駿原作・脚本・監督：徳間書店
- １分骨盤ダイエット すぐに！確実に！キレイにやせる！：大庭史榔：三笠書房
- 生命の法 真実の人生を生き切るには：大川隆法：幸福の科学出版
- 上地雄輔物語：上地雄輔：ワニブックス
- １Ｑ８４(1)１Ｑ８４(2) ：村上春樹：新潮社
- 読めそうで読めない間違いやすい漢字誤読の定番から漢検１級クラスまで：出口宗和：二見書房
- ドラゴンクエストⅨ 星空の守り人 大冒険プレーヤーズガイド：Ｖジャンプ編集部：集英社
- 新・人間革命（20）：池田大作：聖教新聞社
- 日本人の知らない日本語：蛇蔵 海野凪子 ：メディアファクトリー
- バンド１本でやせる！巻くだけダイエット：山本千尋：幻冬舎
- 私服だらけの中居正広増刊号～輝いて～：扶桑社
- 告白：湊かなえ：双葉社
- 脳にいいことだけをやりなさい！頭のいい人は「脳の使い方」がうまい！：マーシー・シャイモフ 茂木健一郎 訳 ：三笠書房
- 体温を上げると健康になる！：齋藤真嗣：サンマーク出版
- オバマ演説集 対訳生声ＣＤ付き：『CNN English Express』編集部：朝日出版社
- 世界一の美女になるダイエット：エリカ・アンギャル：幻冬舎
- 欲情の作法：渡辺淳一：幻冬舎
- 勇気の法 熱血火の如くあれ：大川隆法：幸福の科学出版
- ポケットモンスター ハートゴールド･ソウルシルバー 公式完全クリアガイド ジョウト攻略＋ジョウト図鑑編：元宮秀介、ワンナップ 編著：メディアファクトリー
- しがみつかない行き方「ふつうの幸せ」を手に入れる10のルール：香山リカ：幻冬舎
- ポケットモンスター ハートゴールド・ソウルシルバー 公式完全クリアガイド カントー攻略＋ぜんこく図鑑編：元宮秀介、ワンナップ 編著：メディアファクトリー
- ポケットモンスター ハートゴールド･ソウルシルバー 公式完全ガイドブック ジョウト攻略編＆ジョウト図鑑：ファミ通書籍編集部：エンターブレイン
- ポケットモンスター ハートゴールド･ソウルシルバー ぼうけんマップ＆ポケモンずかん（ジョウト版）：ポケモン､ゲームフリーク､任天堂 監修：小学館
- ポケットモンスター ハートゴールド・ソウルシルバー 公式完全ガイドブック カントー攻略編＆全国図鑑：ファミ通書籍編集部：エンターブレイン